Contribuir a la investigació contra el càncer jugant a un videojoc

Segons informa el diari El Mundo, un equip del Centre de Regulació Genòmica (CRG) i el Centre Nacional d’Anàlisi Genòmica (CNAG-CRG) de Barcelona acaba de llançar GENIGMA, un videojoc gratuït que no només proporciona al jugador entreteniment o diversió. Solucionar els puzles que proposa també serveix per actualitzar la informació genòmica del càncer.

Els seus creadors esperen tenir mapes del genoma de referència molt més precisos que els actuals, una cosa fonamental per a la interpretació dels estudis amb línies cel·lulars. "La falta de mapes de referència del genoma limita el progrés científic actual. És com demanar a algú que es guiï en una ciutat actual amb mapes del passat", apunta Marc Martí-Renom, investigador ICREA i cap del grup de Genòmica Estructural del CNAG-CRG. Actualment, continua, els qui treballen, per exemple amb la línia cel·lular de càncer de mama T-T-47D utilitzen un mapa de referència estàndard, que no és fidel a la realitat. És necessari dibuixar un millor plànol, situant en ell totes les alteracions en les seqüències genòmiques que s’associen al càncer.

Els investigadors podrien haver recorregut a la intel·ligència artificial per aconseguir aquest objectiu, però creuen que les dades generades per les persones poden ser una eina més útil. "Creiem que la lògica humana proporcionarà solucions més creatives, més diverses", subratlla Martí-Renom. "Els algoritmes segueixen unes normes que nosaltres li imposem, es mouen pels mateixos camins, mentre que els jugadors no segueixen cap norma. Cada un farà el que cregui que ha de fer amb el puzle, el que és molt interessant i creiem que pot aportar informació molt valuosa", continua l’investigador, que recorda que les dades obtingudes per aquesta via s’avaluaran posteriorment i es compararan amb els que llancin projectes d’intel·ligència artificial.

L’objectiu del joc és resoldre trencaclosques compostos de cadenes de blocs amb diferents formes i colors. Cada cadena representa una seqüència genètica i la manera en què es col·loquen els blocs -fragments de l’ADN- és una solució potencial per a la seua posició espacial en el genoma. El jugador ha de reorganitzar els blocs, el color del qual i puntuació va canviant en funció de la seua ubicació. "Hem calculat que quan almenys 40 jugadors proporcionin la mateixa solució amb la màxima puntuació, aquesta solució serà considerada la millor possible", assenyala l’investigador.

Perquè el volum de dades sigui suficient i s’augmenti la probabilitat de trobar les seqüències correctes per a cada ubicació, es necessiten almenys 30.000 jugadors que juguin un mínim de 50 partides. I l’objectiu dels creadors és assolir aquesta fita abans de finals d’abril de 2022. En total, fan falta 1.200.000 solucions de puzles per aconseguir un mapa detallat del genoma del càncer de mama, la primera de les línies cel·lulars que abordarà el videojoc.

El joc està disponible de forma gratuïta a les plataformes de iOS i Android en català, castellà, anglès i italià.